മുണ്ടയിൽ കോരൻ്റേയും കല്ല്യാണിയുടെയും ഏറ്റവും ഇളയ മകനായി 24 മെയ് 1945ന് പിണറായി വിജയൻ ജനിച്ചു. ശാരദാവിലാസം ലോവര്‍ പ്രൈമറി സ്കൂള്‍, പെരളശ്ശേരി ഹൈസ്കൂള്‍ എന്നിവിടങ്ങളിൽ നിന്ന് വിജയകരമായി സ്കൂള്‍ വിദ്യാഭ്യാസം പൂർത്തിയാക്കിയ ശേഷം ഒരു വര്‍ഷത്തോളം അദ്ദേഹം നെയ്ത്തു തൊഴിലിൽ ഏര്‍പ്പെടുകയുണ്ടായി. തലശ്ശേരി ബ്രണ്ണൻ കോളേജിൽ നിന്ന് പ്രീഡിഗ്രി പൂർത്തിയാക്കിയ പിണറായി വിജയൻ, 1964ൽ അതേ കോളേജിൽ BA എക്കണോമിക്സിനും ചേര്‍ന്നു